ישיבות ובתי מדרשות עמנואל אטקס הקובץ ישיבות ובתי מדרשות כולל עשרים מאמרים, העוסקים בתולדותיהם של מוסדות לימוד התורה. מן הבחינה הכרונולוגית, נפרשים המאמרים על פני תקופה של כאלפיים שנה: מאז ישיבות התנאים בבבל ועד ל"חברת הלומדים" החרדית ולמדרשות ללימוד תורה של נשים בימינו אלה. ישיבות ובתי מדרשות כולל דיון במגוון רחב של סוגיות. מקצת המאמרים נושאים אופי היסטורי מובהק, כגון: מאימתי התקיימו ישיבות של תנאים בבבל? מה היה יחסם של אמוראי בבל לבתי הדין הפרסיים? האם התקיימו באשכנז מוסדות לימוד תורה נוספים לצדן של ישיבות בעלי התוספות? בכמה מאמרים בולטת הנטייה לדיון בעל אופי טיפולוגי-השוואתי. בכלל דיון זה נבחנות שאלות כגון: מה בין הישיבות בספרד המוסלמית לישיבות אשכנז בימי הביניים? מה היו קווי הדמיון ומה היו ההבדלים בין ישיבות בעלי התוספות בצרפת ובין מוסדות אקדמיים נוצריים בני הזמן והמקום? במה נבדלו זה מזה בתי המדרש לרבנים שפעלו בגרמניה במחצית השנייה של המאה התשע-עשרה? ישיבות ובתי מדרשות כולל גם מאמרים הקוראים תיגר על הדימוי הרווח של מוסדות לימוד התורה ומבקשים להעמידו על דיוקו. מעין אלה הם המאמרים החושפים את התפקיד המכריע שמילאו בתי המדרש המקומיים לצדן של הישיבות. מאמרים אחדים עוסקים בהיבטים רעיוניים של עולם הישיבה. לסוג זה שייכים הדיון במשנתו החינוכית של הרב נתן צבי פינקל והדיון במשנתו של החזון איש. הקובץ שלפנינו מציע דיון מחקרי במגוון רחב של סוגיות מתחום ההיסטוריה של הישיבה מראשיתה ועד ימינו אלה.